發(fā)布日期：2017-09-01
原因不明的感染一向是醫(yī)學上的難題。在電視劇《外科風云》中，在病原檢測不出的情況下，醫(yī)生只能憑借經(jīng)驗嘗試治療。
現(xiàn)在，醫(yī)務(wù)人員有了一種新的利器--基于二代基因測序的病原快檢技術(shù)。這種技術(shù)自進入中國以來，已經(jīng)在眾多疑難感染患者的診斷中到關(guān)鍵性作用。其中，就包括一位來自菲律賓的船員。
生死時速，基因科技“秒揪”病原
今年7月中旬，唐山萬航國際船務(wù)有限公司的一名菲律賓籍船員從唐山啟程。北京協(xié)和醫(yī)院、華大基因和華北理工大學附屬醫(yī)院聯(lián)手解決了他的疑難感染，使他得以平安地踏上歸國之旅。
6月2日，這名船員在船上發(fā)生頭痛、左半身偏癱的癥狀。貨輪就近停靠在唐山，患者先在曹妃甸當?shù)蒯t(yī)院就診，后轉(zhuǎn)至華北理工大學附屬醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科一病區(qū)。
主治醫(yī)生毛文靜回憶，患者來院的時候出現(xiàn)發(fā)熱，左側(cè)瞳孔散大、反射差，左側(cè)手臂完全無力，意識也在逐步喪失，情況危重。腰穿檢測結(jié)果顯示，患者的腦脊液中白細胞含量高、糖類含量低，液體呈微黃色。“感覺上像是結(jié)核性腦膜腦炎。”毛醫(yī)生說，“當即就把結(jié)核藥用上了。”
但醫(yī)院使用常規(guī)的方法，始終沒有找到結(jié)核菌，因此一直采取多種抗菌藥物并用的保守治療方案。在6月12日，神經(jīng)內(nèi)科主任劉斌教授請來北京協(xié)和醫(yī)院的關(guān)鴻志教授，對患者進行會診。
在此之前，從2014年起，協(xié)和醫(yī)院神經(jīng)科與華大基因研究院合作，在國內(nèi)首先開展腦脊液二代測序研究，用于中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染性疾病的病原體篩查。關(guān)鴻志教授正擔任此項目的負責人。他提出建議：試試使用二代基因測序技術(shù)進行的病原快檢。
6月22日下午，天津華大基因交付病原組收到了患者腦脊液樣本。這項檢測一般需要2-3天，此次由于感染危重，華大做了加急處理，30個小時左右就完成了檢測流程。23日晚上，檢測報告出爐，樣本中檢出了結(jié)核分枝桿菌。
獲得了明確的病原信息后，醫(yī)院立即調(diào)整了治療方案，一改之前多管齊下的保守用藥，集中火力向結(jié)核發(fā)起反攻。7月中旬，該患者病情好轉(zhuǎn)、出院回國，繼續(xù)進行抗結(jié)核治療。
菲律賓船員的治療團隊與技術(shù)人員，從左到右依次為：華大基因天津交付李媛，北京協(xié)和醫(yī)院關(guān)鴻志，華北理工大學附屬醫(yī)院劉斌、李世英、毛文靜
廣譜病原檢測，“十年沉疴”一朝解決
現(xiàn)在，利用二代測序技術(shù)進行的病原快檢，比傳統(tǒng)的涂片技術(shù)范圍更廣，比病原培養(yǎng)更加快速。同時，這項技術(shù)的檢測范圍與病原數(shù)據(jù)庫的大小一致，突破了臨床上以往“懷疑什么，檢測什么”的限制，是對抗不明原因感染的新利器。
在二代測序技術(shù)普及之前，一旦出現(xiàn)癥狀不典型的感染，往往需要依賴醫(yī)務(wù)人員的經(jīng)驗，通過涂片、培養(yǎng)等方式進行針對性檢查，常造成病情貽誤。關(guān)鴻志說：“以前在顱內(nèi)感染中，可能有50%的病人--甚至更多的病人，是診斷不清的。試驗性治療治好了就治好了，治不好那就……”
關(guān)鴻志講到，有位內(nèi)蒙古的患者從2007年起持續(xù)頭疼、發(fā)熱，十年間輾轉(zhuǎn)多家醫(yī)院，都沒有得到確診，按照各種感染治療也未痊愈，經(jīng)常需要靠輸液來降低顱壓，生活十分痛苦。
十年后，這位患者的治療終于迎來轉(zhuǎn)機。2016年12月，華大基因和協(xié)和醫(yī)院等多個單位發(fā)起了針對不明病因腦炎腦膜炎的多中心研究，該患者最初就診的醫(yī)院作為中心之一，重新關(guān)注起這個“老”病例。今年5月，該患者的樣本送到華大基因進行檢測，結(jié)果竟然為腦囊蟲病。協(xié)和醫(yī)院針對腦囊蟲進行血清學篩查，很快證實病因?，F(xiàn)在，經(jīng)過對癥治療，該患者已經(jīng)基本痊愈。
“二代測序的方法，不會說懷疑你是什么感染就查什么感染。它會把你腦脊液里的核酸都測一遍，再看看這些核酸分別屬于哪種細菌、哪種病毒，包括哪種蟲子。” 關(guān)鴻志說。
唐山萬航國際船務(wù)有限公司向病原快檢團隊贈送錦旗（圖片由受訪者提供）
二代測序病原快檢將助力民生
更廣、更快、更準確，是二代基因測序病原快檢技術(shù)的優(yōu)勢。例如，華大基因的技術(shù)可以同時檢測2700多種病原微生物和寄生蟲，只要每毫升樣本液體中有100到1000個核酸片段的拷貝，就能檢測出來，鑒定的種屬準確率大于99%。
華大基因是中國最早利用基因測序技術(shù)進行病原檢測的單位之一。早在2003年，華大基因就和相關(guān)單位合作，完成了中國第一例SARS病毒的基因組測序，并向全國防治非典型肺炎指揮部捐贈30萬人份自行研制的SARS病毒診斷試劑盒。
利用基因測序技術(shù)進行病原快檢，不但要求一定的測序能力，還需要完整的病原數(shù)據(jù)庫建設(shè)、算法匹配和分析運算能力、精確解讀的能力。這項技術(shù)在國外已經(jīng)趨于成熟，相關(guān)的科研項目已經(jīng)在國內(nèi)開展，“技術(shù)科普”和整個行業(yè)正當風口。
天津華大基因交付病原組的李媛說：“到今天，臨床的檢測了1276例，送檢單位主要集中在北京和上海。”統(tǒng)計顯示，華大收到的樣本中八成以上來自北京的醫(yī)院。這些醫(yī)院最先從各個方面接觸到這項技術(shù)，并對合適的患者加以應用。
不過，關(guān)鴻志分析，最需要這項技術(shù)的可能是三四線城市的非三甲醫(yī)院，這些醫(yī)院用傳統(tǒng)方法檢測病原的能力更低。普及成本較低、廣譜高效的二代測序病原檢測技術(shù)，減少不明感染的無效經(jīng)驗治療帶來的“折騰”，能夠有效地為診斷、為患者、為醫(yī)患關(guān)系減負，具有重要的民生和社會意義。
來源：醫(yī)谷
